Estudo Sobre a Espectroscopia da Hipericina

Resumo

A molécula de hipericina é um corante amarelo brilhante extraído das pétalas de Hypericum perforatum. Este corante foi estudado extensivamente em conexão com o seu possível uso como fotossensibilizador em protocolos de terapia fotodinâmica para o tratamento do câncer. Neste trabalho obtivemos geometrias em nível MP2 / aug-cc – PVDZ e em nível AM1 para o corante. Usamos a estrutura AM1 envolvida por várias moléculas de solvente para verificar o efeito do solvente no espectro de absorção. Nessa geometria, os espectros eletrônicos em água e em fase gasosa foram calculados com o método INDO / S. O método INDO / S para a molécula solvatada simula o solvente por uma abordagem combinada de supermoléculas com o modelo contínuo . Fizemos uma simulação da hipericina solvatada em água usando o código GROMACS. A caixa de 3nm3 continha uma molécula de hipericina solvatada por 871 moléculas de água. Seguindo o protocolo habitual, procedemos uma equilíbrição inicial da caixa nos conjuntos NpT e NVT. Em seguida, realizamos uma simulação de Dinâmica Molecular de 20 ns e verificamos uma camada de solvatação de 88-102 moléculas de água através dos gráficos de distribuição radial. Nós extraímos um conjunto de 100 configurações termodinamicamente não correlacionadas da simulação para análise de correlação estatística. Concluímos que a metodologia INDO / S é eficiente para a espectroscopia eletrônica de corantes orgânicos, podendo ser usada em computadores pessoais e com baixo custo computacional. No entanto, uma espectroscopia detalhada é necessária através de simulações de dinâmica molecular em diferentes condições para elucidar o mecanismo biológico deste corante.