Virtual HTS and Free Energy Calculation of Brazilian Natural Compounds Using OOMT as Pharmacological Targets Database
Referências
1. R. S. Ferreira and B. Oliva, Quim. Nova, 34, 1770, (2011).
2. M. S. Butler, J. Nat. Prod., 67, 2141, (2004).
3. A. P. Carregal, M. Comar Jr, A. G. Taranto, Biochem. Biotechnol. Reports, 2, 14, (2013).
4. J. J. Irwin, T. Sterling, M. M. Mysinger, E. S. Bolstad, R. G. Coleman, J. Chem. Inf. Model, 52, 1757, (2012).
5. A. K. Rappe, C. J. Casewit, K. S. Colwell, W. Goddard, W. M. Skiff, J. Am. Chem. Soc., 114, 10024, (1992).
6. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr., J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi,
J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, Ö. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski, and D. J. Fox, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009.
7. O. Trott and A. J. Olson, J. Comput. Chem., 31, 455, (2010).
8. B. D. Bursulaya, M. Totrov, R. Abagyan, C. L. Brooks, J. Comput. Aided. Mol. Des., 17, 755, (2004).
9. Accelrys Software Inc., Discovery Studio Modeling Environment, Release 3.1 , San Diego: Accelyrs Software Inc., 2009.
10. G. Lauro, A. Romano, R. Riccio, G. Bifulco, J. Nat. Prod., 74, 1401, (2011).
11. Inc.. All Rights Reserved. Copyright © 2008 Scientific Data Systems Inc.. All Rights Reserved. (2008).
12. W. P. Walters, M. Murcko, Adv. Drug Deliv. Rev., 54, 255, (2002).
13. P. T. Lang, S. R. Brozell, S. Mukherjee, E. F. Pettersen, E. C. Meng, V. Thomas, R. C. Rizzo, D. Case, T. L. James, I. D. Kuntz, RNA, 15, 1219, (2009).
14. M. F. López-Lucendo, D. Sólis, S. A. J. Hirabayashi, K. Kasai, H. Kaltner, H. Gabius, A. Romero, J. Mol. Biol., 343, 957, (2004).
15. E. J. Brnardic, R. M. Garbaccio, M. E. Fraley, E. S. Tasber, J. T. Steen, K. L. Arrington, V. Y. Dudkin, G. D. Hartman, S. M. Stirdivant, B. Drakas, K. Rickert, E. S. Walsh, K. Hamilton, C. Buser, J. Hardwick, W. Tao, S. C. Back, X. Mao, R. B. Lobell, L. Sepp-Lorenzino, Y. Yan, M. Ikuta, S. K. Munshi, L. C. Kuo, C. Kreatsoulas, Bioorganic Med. Chem. Lett., 17, 5989, (2007).
16. R. Amaravadi and C. B. Thompson, J. Clin. Invest., 115, 2618, (2005).
17. A. Onufriev, D. Bashford, D. Case, Proteins Struct. Funct. Genet., 55, 383, (2004).
18. J. Wang, R. M. Wolf, J. W. Caldwell, P. A Kollman, D. A. Case, J. Comput. Chem., 25, 1157, (2004).
2. M. S. Butler, J. Nat. Prod., 67, 2141, (2004).
3. A. P. Carregal, M. Comar Jr, A. G. Taranto, Biochem. Biotechnol. Reports, 2, 14, (2013).
4. J. J. Irwin, T. Sterling, M. M. Mysinger, E. S. Bolstad, R. G. Coleman, J. Chem. Inf. Model, 52, 1757, (2012).
5. A. K. Rappe, C. J. Casewit, K. S. Colwell, W. Goddard, W. M. Skiff, J. Am. Chem. Soc., 114, 10024, (1992).
6. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr., J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi,
J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, Ö. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski, and D. J. Fox, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009.
7. O. Trott and A. J. Olson, J. Comput. Chem., 31, 455, (2010).
8. B. D. Bursulaya, M. Totrov, R. Abagyan, C. L. Brooks, J. Comput. Aided. Mol. Des., 17, 755, (2004).
9. Accelrys Software Inc., Discovery Studio Modeling Environment, Release 3.1 , San Diego: Accelyrs Software Inc., 2009.
10. G. Lauro, A. Romano, R. Riccio, G. Bifulco, J. Nat. Prod., 74, 1401, (2011).
11. Inc.. All Rights Reserved. Copyright © 2008 Scientific Data Systems Inc.. All Rights Reserved. (2008).
12. W. P. Walters, M. Murcko, Adv. Drug Deliv. Rev., 54, 255, (2002).
13. P. T. Lang, S. R. Brozell, S. Mukherjee, E. F. Pettersen, E. C. Meng, V. Thomas, R. C. Rizzo, D. Case, T. L. James, I. D. Kuntz, RNA, 15, 1219, (2009).
14. M. F. López-Lucendo, D. Sólis, S. A. J. Hirabayashi, K. Kasai, H. Kaltner, H. Gabius, A. Romero, J. Mol. Biol., 343, 957, (2004).
15. E. J. Brnardic, R. M. Garbaccio, M. E. Fraley, E. S. Tasber, J. T. Steen, K. L. Arrington, V. Y. Dudkin, G. D. Hartman, S. M. Stirdivant, B. Drakas, K. Rickert, E. S. Walsh, K. Hamilton, C. Buser, J. Hardwick, W. Tao, S. C. Back, X. Mao, R. B. Lobell, L. Sepp-Lorenzino, Y. Yan, M. Ikuta, S. K. Munshi, L. C. Kuo, C. Kreatsoulas, Bioorganic Med. Chem. Lett., 17, 5989, (2007).
16. R. Amaravadi and C. B. Thompson, J. Clin. Invest., 115, 2618, (2005).
17. A. Onufriev, D. Bashford, D. Case, Proteins Struct. Funct. Genet., 55, 383, (2004).
18. J. Wang, R. M. Wolf, J. W. Caldwell, P. A Kollman, D. A. Case, J. Comput. Chem., 25, 1157, (2004).
Publicado
2015-07-01
Como Citar
Carregal, A. P., Maciel, F. V., Carregal, J. B., & Taranto, A. G. (2015). Virtual HTS and Free Energy Calculation of Brazilian Natural Compounds Using OOMT as Pharmacological Targets Database. Revista Processos Químicos, 9(18), 40-44. https://doi.org/10.19142/rpq.v9i18.251
Seção
Artigos Gerais
Copyright (c) 2005 Revista Processos Químicos
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.
