Virtual HTS and Free Energy Calculation of Brazilian Natural Compounds Using OOMT as Pharmacological Targets Database

  • Ana Paula Carregal Universidade Federal de São João del Rei
  • Flávia V. Maciel Universidade Federal de São João del Rei
  • Juliano B. Carregal Universidade Federal de São João del Rei
  • Alex G. Taranto Universidade Federal de São João del Rei

Referências

1. R. S. Ferreira and B. Oliva, Quim. Nova, 34, 1770, (2011).

2. M. S. Butler, J. Nat. Prod., 67, 2141, (2004).

3. A. P. Carregal, M. Comar Jr, A. G. Taranto, Biochem. Biotechnol. Reports, 2, 14, (2013).

4. J. J. Irwin, T. Sterling, M. M. Mysinger, E. S. Bolstad, R. G. Coleman, J. Chem. Inf. Model, 52, 1757, (2012).

5. A. K. Rappe, C. J. Casewit, K. S. Colwell, W. Goddard, W. M. Skiff, J. Am. Chem. Soc., 114, 10024, (1992).

6. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr., J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi,
J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, Ö. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski, and D. J. Fox, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009.

7. O. Trott and A. J. Olson, J. Comput. Chem., 31, 455, (2010).

8. B. D. Bursulaya, M. Totrov, R. Abagyan, C. L. Brooks, J. Comput. Aided. Mol. Des., 17, 755, (2004).

9. Accelrys Software Inc., Discovery Studio Modeling Environment, Release 3.1 , San Diego: Accelyrs Software Inc., 2009.

10. G. Lauro, A. Romano, R. Riccio, G. Bifulco, J. Nat. Prod., 74, 1401, (2011).

11. Inc.. All Rights Reserved. Copyright © 2008 Scientific Data Systems Inc.. All Rights Reserved. (2008).

12. W. P. Walters, M. Murcko, Adv. Drug Deliv. Rev., 54, 255, (2002).

13. P. T. Lang, S. R. Brozell, S. Mukherjee, E. F. Pettersen, E. C. Meng, V. Thomas, R. C. Rizzo, D. Case, T. L. James, I. D. Kuntz, RNA, 15, 1219, (2009).

14. M. F. López-Lucendo, D. Sólis, S. A. J. Hirabayashi, K. Kasai, H. Kaltner, H. Gabius, A. Romero, J. Mol. Biol., 343, 957, (2004).

15. E. J. Brnardic, R. M. Garbaccio, M. E. Fraley, E. S. Tasber, J. T. Steen, K. L. Arrington, V. Y. Dudkin, G. D. Hartman, S. M. Stirdivant, B. Drakas, K. Rickert, E. S. Walsh, K. Hamilton, C. Buser, J. Hardwick, W. Tao, S. C. Back, X. Mao, R. B. Lobell, L. Sepp-Lorenzino, Y. Yan, M. Ikuta, S. K. Munshi, L. C. Kuo, C. Kreatsoulas, Bioorganic Med. Chem. Lett., 17, 5989, (2007).

16. R. Amaravadi and C. B. Thompson, J. Clin. Invest., 115, 2618, (2005).

17. A. Onufriev, D. Bashford, D. Case, Proteins Struct. Funct. Genet., 55, 383, (2004).

18. J. Wang, R. M. Wolf, J. W. Caldwell, P. A Kollman, D. A. Case, J. Comput. Chem., 25, 1157, (2004).
Publicado
2015-07-01
Como Citar
Carregal, A. P., Maciel, F. V., Carregal, J. B., & Taranto, A. G. (2015). Virtual HTS and Free Energy Calculation of Brazilian Natural Compounds Using OOMT as Pharmacological Targets Database. Revista Processos Químicos, 9(18), 40-44. https://doi.org/10.19142/rpq.v9i18.251